Đội 1 Quảng Nam lên hạng V.League năm 2013 và bước lên đỉnh cao với chức vô địch năm 2017 dưới sự dẫn dắt của huấn luyện viên Hoàng Văn Phúc. Tuy nhiên, ngay trong chiến tích đó, một lỗ hổng đã lộ ra khi đội không được dự Cúp AFC 2018, vì không tham dự đầy đủ các giải trẻ quốc gia theo quy định.
Việc chỉ đầu tư mạnh cho đội 1, khiến công tác đào tạo trẻ nơi đây có một thời gian bị lơ là. Trong thành tích vô địch V.League 2017, Huỳnh Tấn Sinh là cầu thủ hiếm hoi trưởng thành từ lò đào tạo của đội.
Tuy nhiên trong 2 năm trở lại đây, việc đào tạo bóng đá trẻ tại Quảng Nam đã có chuyển biến tích cực. Đội bóng đã xây dựng được các tuyến U kế cận nhau gồm U13, U15, U17 và U19. Từ chỗ thường xuyên vắng bóng ở các vòng chung kết giải quốc gia, bóng đá Quảng Nam đã có 2 đội dự vòng chung kết U13, U15 Quốc gia 2020. Đặc biệt ở giải U15 Quốc gia 2020, U15 Quảng Nam đã loại cả U15 HAGL để giành vé đi tiếp.
Tỉnh đã đầu tư gần 20 tỉ đồng để xây dựng một sân tập cũng như một khu nhà ở dành cho các cầu thủ ở tuyến trẻ trong năm 2019. Với câu lạc bộ bóng đá Quảng Nam, trong năm 2018 đã thành lập Trung tâm đào tạo bóng đá trẻ Quảng Nam do cựu huấn luyện viên đội U20 Việt Nam – Đoàn Phùng phụ trách. Số tiền ngân sách được tỉnh rót xuống cho đội bóng được chi một phần lớn để ươm mầm các tài năng.
Ước tính năm ngoái, Quảng Nam đã chi 7 tỉ đồng cho việc đào tạo trẻ. Một số cầu thủ từ tuyến trẻ như thủ môn Ngọc Bin, tiền vệ Văn Trạng được đôn lên đội 1… Điều đó khẳng định bước đi đúng đắn của đội bóng, tạo nền móng vững chắc để phát triển bóng đá trong tương lai.
Quảng Nam xuống hạng, tuy nhiên huấn luyện viên Nguyễn Thành Công vẫn cam kết ở lại với đội, làm lại từ giải hạng Nhất. Đội trưởng Đinh Thanh Trung cũng để ngỏ việc tiếp tục gắn bó với đội chủ sân Tam Kỳ.
Quảng Nam sẽ là ứng viên nặng ký để giành suất thăng hạng lên V.League 2022, nếu họ vẫn giữ được bộ khung ổn định. Quan trọng hơn, mục tiêu này tiếp tục song hành cùng việc củng cố, phát triển hơn nữa việc đào tạo trẻ để bóng đá xứ Quảng sẽ có thể “sống khỏe” bằng nguồn cầu thủ của địa phương trong tương lai gần.
Ngoài các tuyến đào tạo trẻ của tỉnh, câu lạc bộ Quảng Nam, vào năm 2019, Trung tâm bóng đá cộng đồng của cựu cầu thủ Đặng Đức Nhật đã ra đời tại thành phố Tam Kỳ. Đây là trung tâm bóng đá cộng đồng đầu tiên tại địa phương. Đức Nhật vốn là cựu cầu thủ Quảng Nam, Cảng Sài Gòn. Anh mong muốn thông qua các lớp dạy bóng đá sẽ giới thiệu được nhiều em có năng khiếu để tiếp tục tham gia đào tạo tại câu lạc bộ, trở thành những cầu thủ trong tương lai.