Thực hiện Quyết định số 1299/QĐ-TLĐ ngày 09.9.2020 của Tổng Liên đoàn Lao động Việt Nam về việc ban hành Quy định chức năng, nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, biên chế cơ quan Công đoàn ngành Trung ương; Quyết định số 3304/QĐ-TLĐ ngày 01.10.2021 của Đoàn Chủ tịch Tổng Liên đoàn về phê duyệt Đề án sắp xếp, kiện toàn tổ chức bộ máy và biên chế Cơ quan Công đoàn Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam, Ban Thường vụ Công đoàn Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam đã ban hành các Quyết định về công tác tổ chức bộ máy, cán bộ Cơ quan Công đoàn Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam.
Theo đó, kể từ ngày 01.01.2022, Công đoàn Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam có 04 ban nghiệp vụ. Trong đó, Ban Tổ chức - Kiểm tra (trên cơ sở hợp nhất Ban Tổ chức và Văn phòng Ủy ban Kiểm tra); Ban Chính sách pháp luật và Quan hệ lao động; Ban Tuyên giáo - Nữ công (trên cơ sở hợp nhất Ban Tuyên giáo và Ban Nữ công); Văn phòng (trên cơ sở hợp nhất Ban Tài chính và Văn phòng).