Đại hội có sự tham dự của 549 đại biểu chính thức, đại diện cho gần 1,4 triệu CNLĐ trên địa bàn thành phố về dự đại hội. Đại hội gồm 4 phiên làm việc và kéo dài trong 3 ngày, từ ngày 22 đến ngày 24.9.
Tại phiên làm việc thứ nhất, đại biểu đã thống nhất bầu ra đoàn chủ tịch, đoàn thư ký, ban thẩm tra tư cách đại biểu. Đại hội cũng biểu quyết thông qua chương trình làm việc, quy chế Đại hội và báo cáo kết quả thẩm tra tư cách đại biểu dự Đại hội.
Phiên làm việc thứ nhất diễn ra với các nội dung: Báo cáo kiểm điểm của Ban Chấp hành LĐLĐ TPHCM lần thứ XI, nhiệm kỳ 2018-2023; Báo cáo tổng hợp ý kiến đóng góp văn kiện Đại hội XIII Công đoàn Việt Nam và dự thảo Điều lệ Công đoàn Việt Nam (sửa đổi, bổ sung), chia tổ thảo luận các nội dung dự thảo văn kiện Đại hội XIII Công đoàn Việt Nam (sửa đổi, bổ sung).
Trước khi phiên làm việc thứ nhất Đại hội Công đoàn TPHCM lần thứ XII diễn ra, sáng 22.9, Đoàn đại biểu CNVC-LĐ thành phố do bà Trần Thị Diệu Thúy, Chủ tịch LĐLĐ TPHCM làm trưởng đoàn đã đến dâng hương, dâng hoa tưởng niệm tại Bảo tàng Hồ Chí Minh – Chi nhánh TPHCM, Phòng Tưởng niệm Chủ tịch Tôn Đức Thắng (Quận 4, TPHCM) và Công viên Tượng đài Chủ tịch Hồ Chí Minh (Quận 1, TPHCM).
Trong ngày làm việc thứ 2 (vào ngày 23.9), đại biểu nghe báo cáo kết quả thực hiện Nghị quyết Đại hội Công đoàn TPHCM lần thứ XI và thông qua phương hướng, nhiệm vụ nhiệm kỳ 2023-2028. Sau đó, đại hội tiến hành bầu cử Ban Chấp hành khóa XII, nhiệm kỳ 2023-2028 và bầu Đoàn Đại biểu dự Đại hội XIII Công đoàn Việt Nam.