Nhiệm kỳ 2013 - 2018, Công đoàn ngành thực hiện tốt công tác chăm lo bảo vệ quyền và lợi ích hợp pháp cho NLĐ. Các cấp CĐ tham gia kiểm tra, giám sát chế độ chính sách, việc thực hiện quy chế dân chủ cơ sở. Cụ thể: gần 3.000 LĐ ký HĐLĐ đạt 93%; 98% lao động được tham gia BHXH, BHYT, BHTN; 100% DN tổ chức đối thoại định kỳ; tư vấn, tháo gỡ cho NLĐ truy lĩnh gần 600 triệu đồng. CĐ ngành vận động tốt các DN thực hiện nâng cao chất lượng bữa ăn ca từ 15.000đ/suất – 35.000đ/suất. Đặc biệt chủ động phối hợp các ban, ngành chức năng khảo sát, vận động thành lập nghiệp đoàn nghề cá, hỗ trợ ngư dân vươn khơi...

Hoạt động xã hội luôn được các cấp CĐ quan tâm và tích cực đóng góp. Với tinh thần “tương thân, tương ái”, CĐ ngành đã hỗ trợ cho 132 trường hợp khó khăn, 78 trường hợp thiệt hại nặng trong bão lũ với tổng kinh phí gần 250 triệu đồng.

5 năm qua, phong trào thi đua yêu nước được CĐ ngành phát động rộng rãi. Đã có 217 sáng kiến, cải tiến kỹ thuật của CNLĐ được áp dụng, làm lợi hơn 2 tỷ đồng.

Tại Đại hội III, các đại biểu đã đưa ra nhiều kiến nghị liên quan đến chế độ cho lao động ngành thủy sản, chế độ khen thưởng, nới lỏng quy chế xét tặng kỉ niệm chương...; đồng thời biểu quyết thống nhất 10 chỉ tiêu nhiệm kỳ tới, trong đó có một số điểm nổi bật như: 90% LĐ được đào tạo nghề sau khi tuyển dụng; không có trường hợp vi phạm quyền, lợi ích hợp pháp, chính đáng của NLĐ; phát triển 5 CĐCS, 500 ĐV và 95% LĐ sau kí hợp đồng 3 tháng sẽ gia nhập công đoàn...

Ban Chấp hành nhiệm kỳ 2018-2023 được Đại hội thông qua có 15 người. Ông Lê Bá Ninh, Phó Giám đốc Sở NNPTNN trúng cử Chủ tịch CĐ ngành nhiệm kỳ 2018-2023.