Điểm sàn xét tuyển với mức cao nhất 24 ở ngành Y khoa và Răng - Hàm - Mặt, ngành Dược lấy điểm sàn 23. Các ngành còn lại lấy điểm sàn 19. Ngành Khúc xạ Nhãn khoa kèm theo điều kiện điểm thi môn tiếng Anh phải ≥ 7 điểm.
Theo đề án tuyển sinh mà trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch công bố năm 2020, tổng chỉ tiêu tuyển của trường là 1.350 sinh viên đại học chính quy.
Số chỉ tiêu này phân bố 50% cho thí sinh có hộ khẩu TPHCM, còn lại cho các tỉnh thành khác. Trong đó, ngành Y khoa có chỉ tiêu lớn nhất là 800, ngành Răng Hàm Mặt 80, Dược học 80.