Theo hướng dẫn dạy học các môn chuyên trong trường THPT chuyên được Bộ Giáo dục và Đào tạo ban hành cuối tháng 8, học sinh trường chuyên sẽ lựa chọn môn học như sau:
- Đối với lớp chuyên Toán, Ngữ văn, Lịch sử: Học sinh lựa chọn học 4 môn học trong 9 môn học lựa chọn. Đối với chuyên đề học tập lựa chọn, ngoài cụm chuyên đề học tập lựa chọn thuộc chương trình môn chuyên, học sinh chọn 2 cụm chuyên đề học tập lựa chọn của 2 môn học khác môn chuyên trong 4 môn học đã lựa chọn và các môn Toán, Ngữ văn, Lịch sử.
- Đối với lớp chuyên Vật lí, Hóa học, Sinh học, Địa lí, Tin học: Học sinh lựa chọn học 3 môn học (khác môn chuyên) trong 9 môn học lựa chọn. Đối với chuyên đề học tập lựa chọn, ngoài cụm chuyên đề học tập lựa chọn thuộc chương trình môn chuyên, học sinh chọn 2 cụm chuyên đề học tập của 2 môn học trong 6 môn học gồm 3 môn học đã lựa chọn và các môn Toán, Ngữ văn, Lịch sử.
- Đối với lớp chuyên Ngoại ngữ: Học sinh lựa chọn 4 môn học trong 9 môn học lựa chọn. Đối với chuyên đề học tập lựa chọn, học sinh chọn 3 cụm chuyên đề học tập lựa chọn của 3 môn học trong 7 môn học, gồm 4 môn học đã lựa chọn và các môn Toán, Ngữ văn, Lịch sử.
Học sinh chuyên vẫn sử dụng các đầu sách sách giáo khoa theo danh mục được Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo phê duyệt và UBND tỉnh/thành phố lựa chọn.
Năm học 2022-2023 là năm học đầu tiên triển khai Chương trình giáo dục phổ thông 2018 đối với cấp THPT.
Theo chương trình mới, học sinh lớp 10 học 8 môn và hoạt động giáo dục bắt buộc gồm Ngữ văn; Toán; Ngoại ngữ 1; Lịch sử; Giáo dục thể chất; Giáo dục Quốc phòng và An ninh, Hoạt động trải nghiệm, hướng nghiệp; Nội dung giáo dục địa phương.
Ngoài các môn học bắt buộc, các em được lựa chọn 4 môn trong số 9 môn: Địa lý, Giáo dục kinh tế và pháp luật, Vật lý, Hóa học, Sinh học, Công nghệ, Tin học, Âm nhạc, Mỹ thuật.
Theo lý thuyết, học sinh được tự lựa chọn theo định hướng và sở thích cá nhân. Tuy nhiên, do điều kiện thực tế về cơ sở vật chất, giáo viên, các nhà trường đều đưa ra một số tổ hợp môn để học sinh chọn trong số đó. Điều này dẫn đến có trường hợp học sinh không được học môn yêu thích. Thậm chí, nhiều trường chưa thể triển khai dạy học một số môn mới như Âm nhạc, Mỹ thuật,...