Theo đó, ông Nguyễn Tấn Tuân - Chủ tịch UBND tỉnh có ý kiến thống nhất xác định phạm vi, ranh giới khu vực xây dựng đề án theo phương án đề xuất của BQL Khu kinh tế Vân Phong, gồm: Khu vực phía Bắc (gồm xã Vạn Thạnh và khu vực phía Đông Quốc lộ 1A thuộc các xã Vạn Thọ, Vạn Phước, Vạn Khánh, Vạn Long và Vạn Thắng, huyện Vạn Ninh); Khu vực phía Nam (tập trung tại khu vực Đông Bắc, thị xã Ninh Hòa, thuộc phường Ninh Hải và một phần diện tích xã Ninh Thọ).
Trước mắt, để tạo ra cú "hích", động lực phát triển ngay các khu vực trong đề án, UBND tỉnh Khánh Hòa đề nghị BQL Khu kinh tế Vân Phong nghiên cứu, ưu tiên đưa vào đề án để kêu gọi đầu tư đối với các ngành nghề liên quan đến dịch vụ, du lịch nghỉ dưỡng, cảng biển. Trên cơ sở đó, nghiên cứu, đề xuất các chính sách ưu đãi phù hợp trong đề án để thu ngay ngành nghề này.
Trên cơ sở tham khảo các chính sách ưu đãi đã được Trung ương cho phép thực hiện tại huyện đảo Phú Quốc (tỉnh Kiên Giang), Vân Đồn (tỉnh Quảng Ninh) và Khu kinh tế mở Chu Lai (tỉnh Quảng Nam), UBND tỉnh Khánh Hòa đề nghị BQL Khu kinh tế Vân Phong nghiên cứu, chọn lọc để đưa vào đề án, đảm bảo có tính khả thi cao.
UBND tỉnh Khánh Hòa cũng đề nghị BQL Khu kinh tế Vân Phong nghiên cứu, đề xuất UBND tỉnh hướng xử lý về một số nội dung liên quan sau khi đề án được triển khai thực hiện, cụ thể là tách bạch tương đối về chức năng quản lý hành chính Nhà nước theo địa giới hành chính và chức năng quản lý kinh tế tại khu vực triển khai đề án; đầu tư phát triển hạ tầng kỹ thuật phục vụ cho phát triển kinh tế đảm bảo, phù hợp với phát triển xã hội trong khu vực thực hiện đề án.