Theo đó, kết luận thanh tra số 430 ngày 4.5 của Thanh tra TP Cần Thơ nêu rõ, quá trình thực hiện cổ phần hóa tại công ty này có một số sai phạm như thực hiện không đúng quy định khi xử lý quỹ khen thưởng và phúc lợi công ty.

Thực hiện chưa đầy đủ theo quy định khi xác định giá trị lợi thế kinh doanh theo quy định. Chưa thực hiện đúng quy định khi xác định giá trị doanh nghiệp đối với các khoản nợ phải,  chưa thực hiện đúng nghĩa vụ về thuế.

Thanh tra TP Cần Thơ kiến nghị Chủ tịch UBND TP Cần Thơ chỉ đạo Công ty Cổ phần Đô thị Cần Thơ kiểm điểm, xử lý trách nhiệm đối với sai phạm của Chủ tịch, Giám đốc Công ty TNHH MTV Công trình đô thị TP Cần Thơ và các tổ chức, cá nhân có liên quan cả giai đoạn từ 1.1.2014 đến 31.10.2014 và giai đoạn từ 1.11.2014 đến 2.7.2015 do không xây dựng phương án, sử dụng sai và phải chịu trách nhiệm với số tiền hơn 7,2 tỷ đồng quỹ khen thưởng và phúc lợi.

Thanh tra kiến nghị buộc thu hồi nộp Ngân sách Nhà nước hơn 403 triệu đồng. Trong đó: Thu hồi số tiền do Đoàn thanh tra xác định tăng phần vốn Nhà nước tại doanh nghiệp khi cổ phần hóa doanh nghiệp Nhà nước hơn 180 triệu đồng; Thu số tiền nộp phạt thuế thu nhập doanh nghiệp khai thiếu hơn 159 triệu đồng; Tiền nộp chậm thuế thu nhập doanh nghiệp với tổng số tiền hơn 63 triệu đồng. Công ty Cổ phần Đô thị Cần Thơ có trách nhiệm chuyển số tiền phải thu hồi vào tài khoản tạm thu chờ xử lý của Thanh tra thành phố Cần Thơ.