Theo đó, thực hiện Nghị quyết số 18 ngày 25.10.2017 của Ban chấp hành Trung ương khóa XII, quy định một số vấn đề về tiếp tục đổi mới, sắp xếp tổ chức bộ máy của hệ thống chính trị, tinh gọn, hoạt động, hiệu quả. Tổng cục Thuế đã xây dựng Đề án sắp xếp, hợp nhất Chi cục Thuế cấp huyện để thành lập Chi cục Thuế khu vực.

Theo lộ trình đến hết năm 2020, toàn hệ thống thuế sẽ phải hợp nhất khoảng 548 Chi cục Thuế quận, huyện, thị xã, thành phố của 63 Cục Thuế thành 257 Chi cục Thuế khu vực, giảm 291 Chi cục Thuế, chỉ còn 420 Chi cục Thuế cấp quận, huyện, thị xã, thành phố trong toàn quốc.

Năm 2018, Tổng cục thuế đã thí điểm sắp xếp, hợp nhất Chi cục thuế khu vực tại 6 Cục thuế là Quảng Ninh, Hải Dương, Yên Bái, Quảng Ngãi, Lâm Đồng, Cà Mau, hợp nhất 34 Chi cục Thuế thành 16 Chi cục Thuế khu vực, giảm 18 chi cục thuế.

Từ thành công của việc thí điểm, năm 2019, Tổng cục Thuế tiếp tục triển khai 5 đợt sắp xếp và trong tháng 1-2.2020, Tổng cục Thuế đã thực hiện xong 2 đợt xắp sếp cuối cùng.

Đến nay, Bộ trưởng Bộ Tài chính đã ký ban hành 111 Quyết định thành lập chi cục thuế khu vực trực thuộc 63 cục thuế tỉnh, thành phố trong cả nước, qua đó, tiến hành sắp xếp hợp nhất 565 chi cục thuế để thành lập 269 chi cục thuế khu vực, giảm 296 chi cục thuế.

Số lượng Chi cục Thuế sau khi hợp nhất còn lại là 415 Chi cục Thuế, đạt 102% kế hoạch và vượt thời gian trước 10 tháng theo quyết định số 41 ngày 25.9.2019 của Thủ tướng Chính phủ.