Theo Sở TNMT: Bộ TNMT đã có báo cáo số 67/BC-BTNMT ngày 14.7.2017 báo cáo Thủ tướng Chính phủ. Trong đó, Bộ TNMT kiến nghị Thủ tướng Chính phủ giao UBND TPHCM “nghiên cứu, rà soát khả năng tiếp nhận và xử lý rác thải của VWS. Trường hợp không đáp ứng, phải có biện pháp chuyển rác thải đến các vị trí cơ sở thu gom, xử lý rác thải có chức năng đang hoạt động trên địa bàn TPHCM”.
Thực hiện chỉ đạo trên, Sở TNMT đã đề nghị VWS, trong quá trình tiếp nhận xử lý 5.800 tấn rác/ngày (chiếm 66% tổng lượng rác ở TPHCM), có báo cáo đánh giá toàn diện về những khó khăn, điều kiện đảm bảo vận hành của các hệ thống/công trình xử lý chất thải và phương tiện máy móc thiết bị...; khả năng tiếp nhận xử lý chất thải của VWS trong thời gian tới.
Trên cơ sở đó, Sở TNMT sẽ cùng sở, ngành liên quan làm căn cứ rà soát, đề xuất UBND TP hướng giải quyết... Ngoài ra, cũng tại văn bản 1063, Sở TNMT cho biết: Hiện VWS đang lưu chứa gần 700.000m3 nước thải không đúng quy định. Và, với công suất xử lý của VWS hiện nay, phải mất 1 năm mới xử lý xong 700.000m3 nước thải trên.
Trong lúc đó, việc xây dựng nhà máy MBR mở rộng công suất 2.000m3/ngày, VWS chưa đảm bảo thời gian vận hành thử nghiệm, do gặp khó khăn “nuôi cấy vi sinh” v.v... Do đó, việc kéo dài xây dựng nhà máy xử lý nước thải là rất rõ. Sở TNMT cho rằng, việc này sẽ “không đáp ứng tiến độ xử lý nước thải/nước rỉ rác đang lưu chứa”, như VWS cam kết khắc phục...
Mặt khác, theo kết luận của Bộ TNMT, thì tại VWS “bùn thải nguy hại thu gom từ hệ thống xử lý Fenton (sử dụng phèn sắt) lại được tự ý chôn lấp trái phép cùng rác thải sinh hoạt tại ô chôn lấp”. Sở TNMT yêu cầu VWS báo cáo việc làm sai phạm này; trước mắt, chấm dứt ngay sự việc nêu trên.
Trong khi đó, VWS cam kết sẽ có giải pháp điều chỉnh đổi mới công nghệ, nhằm hạn chế việc chôn lấp tại Khu liên hợp Đa Phước. Tuy nhiên đến nay, VWS vẫn chưa lập dự án “điều chỉnh, đổi mới công nghệ” để trình nộp cơ quan chức năng... Đầu năm 2018, nhiều hộ dân ở xã Đa Phước, huyện Bình Chánh đã khiếu nại VWS gây sự cố tràn nước thải chưa xử lý khiến người dân bị thiệt hại về nuôi trồng thủy sản, hoa màu...