Chiều và tối 5.9, khu vực Trung Bộ, Tây Nguyên và Nam Bộ có mưa rào và dông, cục bộ có mưa to đến rất to. Một số nơi có lượng mưa lớn như: Hương Sơn (Hà Tĩnh) 85.6mm, Ninh Hoà (Khánh Hoà) 100mm, Tuy An (Phú Yên) 63.6mm, An Khê (Gia Lai) 50.0mm, Định Quán (Đồng Nai) 63.4mm, Củ Chi (TP. HCH) 62.8mm,…

Trung tâm Dự báo Khí tượng Thuỷ văn Quốc gia dự báo, do ảnh hưởng của rìa phía bắc rãnh áp thấp đi qua khu vực Trung Trung Bộ kết hợp với rìa tây lưỡi áp cao cận nhiệt đới nên từ  ngày 6.9 đến ngày 7.9, Bắc Bộ và Thanh Hóa có mưa rào và dông rải rác, cục bộ có mưa to đến rất to với lượng mưa từ 30-70mm/24h, có nơi trên 90mm/24h.

Khu vực Hà Nội từ ngày 6.9 đến ngày 7.9 có lúc có mưa rào và dông, cục bộ có mưa vừa, mưa to.

Ngoài ra, do ảnh hưởng của rãnh áp thấp kết hợp với gió mùa Tây Nam có cường độ trung bình nên chiều và tối mai (6.9), ở khu vực Trung Bộ, Tây Nguyên và Nam Bộ có mưa rào và dông, cục bộ có mưa to đến rất to với lượng mưa 40-80mm, có nơi trên 120mm.

Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc, sét, mưa đá và gió giật mạnh. Nguy cơ xảy ra lũ quét, sạt lở đất cục bộ tại khu vực miền núi và ngập úng cục bộ tại những vùng, đô thị trũng thấp.

Trung tâm Dự báo Khí tượng Thuỷ văn Quốc gia cảnh báo, từ đêm 7.9 đến ngày 9.9, mưa dông ở các khu vực có khả năng gia tăng. Riêng đồng bằng Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ có khả năng mưa to, cục bộ có mưa rất to.

Về thời tiết biển, do ảnh hưởng của rãnh áp thấp kết hợp với gió mùa tây nam cường độ trung bình nên Vịnh Bắc Bộ, khu vực Biển Đông (bao gồm cả vùng biển quần đảo Hoàng Sa và Trường Sa), vùng biển từ Quảng Trị đến Cà Mau, Cà Mau đến Kiên Giang và Vịnh Thái Lan có mưa rào và dông. Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc xoáy và gió giật mạnh.