Theo vị đại diện Viện Kiểm sát, với vị trí là Cục trưởng Cục đăng kiểm Việt Nam nên bị cáo Đặng Việt Hà phải chịu trách nhiệm cao nhất. Từ đó bị cáo này bị Viện Kiểm sát đề nghị mức án 20 năm về tội "nhận hối lộ".
Bị cáo Trần Kỳ Hình (cựu Cục trưởng Cục đăng kiểm Việt Nam) bị đề nghị 18-19 năm tù về tội "nhận hối lộ" và 5-6 năm tù về "tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ". Tổng hợp hình phạt đề nghị từ 23-25 năm tù.
Bị cáo Trần Anh Quân (Trưởng phòng VAR) bị đề nghị mức án 17-18 năm tù về tội "nhận hối lộ".
Bị cáo Nguyễn Vũ Hải (cựu Phó Cục trưởng Cục Đăng kiểm Việt Nam) bị đề nghị 4-5 năm tù về tội "lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Bị cáo Trần Lập Nghĩa (Giám đốc các Trung tâm đăng kiểm 62-03D - Long An; 71-02D - Bến Tre; 83-02D - Sóc Trăng) bị đề nghị mức án từ 28-30 năm tù về ba tội: nhận hối lộ, giả mạo trong công tác và xâm nhập trái phép vào mạng máy tính, mạng viễn thông hoặc phương tiện điện tử của người khác.
Đại diện Viện kiểm sát đang tiếp tục đề nghị mức án đối với các bị cáo khác trong vụ án.
Theo Viện Kiểm sát, các bị cáo trong vụ án đều có trình độ chuyên môn nhưng đã lợi dụng chức vụ để trục lợi cá nhân, gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến an toàn giao thông và niềm tin của người dân. Viện kiểm sát đề nghị mức án nghiêm khắc để răn đe, đặc biệt là đối với những người đứng đầu.
Tuy nhiên, Viện kiểm sát cũng đề nghị xem xét giảm nhẹ cho các bị cáo là đồng phạm, thực hiện theo chỉ đạo cấp trên. Một số bị cáo, bao gồm cả cựu cục trưởng Đặng Việt Hà và Trần Kỳ Hình, bị xác định là phạm tội có tổ chức và nhiều lần, cần xử lý nghiêm.
Mặc dù vậy, Viện kiểm sát cũng ghi nhận các tình tiết giảm nhẹ của các bị cáo như nhân thân tốt, thành khẩn khai báo, khắc phục hậu quả, và đề nghị Hội đồng xét xử xem xét giảm nhẹ một phần hình phạt.
Theo cáo trạng, các bị cáo nguyên là lãnh đạo Cục Đăng kiểm Việt Nam, lãnh đạo các phòng, đến lãnh đạo nhiều trung tâm, chi cục đăng kiểm thống nhất chỉ đạo các đăng kiểm viên cấp dưới, các nhân viên làm việc ở các trung tâm, chi cục nhận tiền từ các chủ xe, chủ tàu. Qua đó, bỏ qua lỗi, bỏ qua các điều kiện về chất lượng, an toàn kỹ thuật, an toàn lao động, bảo vệ môi trường... trong đăng kiểm, thẩm định hồ sơ thiết kế.
Tuy nhiên, Trần Kỳ Hình, Đặng Việt Hà (đều là cựu Cục trưởng Cục Đăng kiểm Việt Nam), Nguyễn Vũ Hải (cựu Phó Cục trưởng Cục Đăng kiểm Việt Nam) đã không thực hiện đúng chức trách, nhiệm vụ, đưa ra chủ trương làm trái quy định và nhận hối lộ số tiền đặc biệt lớn. Điều này dẫn đến sai phạm, tiêu cực mang tính hệ thống, trong thời gian dài tại các phòng trực thuộc Cục Đăng kiểm Việt Nam, nhiều trung tâm đăng kiểm, chi cục đăng kiểm trên cả nước.
Cáo trạng xác định, bị cáo Trần Kỳ Hình nhận hối lộ hơn 7,1 tỉ đồng và lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong duyệt cấp thông báo năng lực cho 63 hồ sơ cơ sở đóng tàu không đủ điều kiện.
Bị cáo Đặng Việt Hà phải chịu trách nhiệm hình sự cho toàn bộ việc nhận hối lộ của cấp dưới là 40 tỉ đồng, trong đó cá nhân bị cáo Hà nhận riêng 8,5 tỉ đồng.