Tại phiên tòa, luật sư Lê Hồng Nguyên – người bào chữa cho bị cáo Đinh Ngọc Hệ đề nghị thay đổi người tố tụng. Tuy nhiên, theo đại diện VKS cho biết, những đề nghị của luật sư hoàn toàn không có căn cứ. Do đó, VKS đề nghị HĐXX bác yêu cầu của luật sư.
Sau khi hội ý, HĐXX nhận định những đề nghị của luật sư Nguyên tại phiên tòa không có căn cứ, phiên tòa tiếp tục làm việc.
Trong vụ án, những người có quyền lợi nghĩa vụ liên quan kháng cáo gồm Cty BOT Việt Trì, Cty CP Yên Khánh Hải Thành; Cty Xăng dầu Thái Sơn Bộ Q.P, Cty TNHH BOT và BT quốc lộ 20, Cty CP Tập đoàn Yên Khánh, Cty Dịch vụ và Du lịch biển đảo Hải Thành, ngân hàng BIDV.
Trong 7 bị cáo có đơn kháng cáo, ông Nguyễn Văn Hiến xin tòa phúc thẩm cho áp dụng hình phạt cải tạo không giam giữ hoặc hưởng án treo. Các bị cáo Bùi Như Thiềm, Bùi Văn Nga, Đoàn Mạnh Thảo xin được giảm nhẹ hình phạt hoặc xin hưởng án treo.
Các bị cáo Đinh Ngọc Hệ, Trần Trọng Tuấn kháng cáo kêu oan; bị cáo Phạm Văn Diệt kháng cáo xin xem xét lại tội danh và xin giảm nhẹ hình phạt, hủy bỏ hình phạt bổ sung với mình.
Bị cáo Đinh Ngọc Hệ - nguyên Thượng tá, Phó Giám đốc công ty Thái Sơn Bộ Quốc phòng đã lập công ty Yên Khánh, cho cháu mình là Vũ Thị Hoan làm giám đốc. Năm 2006, Hệ đề nghị QCHQ cho Yên Khánh liên doanh với Hải Thành để xây cao ốc trên khu đất quốc phòng số 7 – 9 Tôn Đức Thắng. Tuy nhiên, bị cáo Hệ chỉ đạo nhân viên lấy sổ đỏ khu đất đem đi thế chấp tại ngân hàng BIDV để các doanh nghiệp của mình vay tiền.
Trong vụ án, bị cáo Nguyễn Văn Hiến – nguyên Tư lệnh Quân chủng Hải quân (QCHQ) có vai trò cao nhất trong quản lý đất đai thuộc hải quân nhưng không làm hết nhiệm vụ; thiếu kiểm tra, đôn đốc cán bộ cấp dưới thuộc quyền; thiếu kiểm tra tính hợp pháp nên đã ký văn bản do cấp dưới trình, quyết định việc đưa 3 khu đất trên vào làm kinh tế sai quy định.
Theo tòa sơ thẩm, năm 2006, Cty Yên Khánh mới lập nhưng bị cáo Hệ chỉ đạo Vũ Thị Hoan lập tờ trình phản ánh sai sự thật năng lực để xin liên doanh với Hải Thành nhằm xây cao ốc trên khu đất số 7 - 9 . Được đồng ý, bị cáo Hệ chỉ đạo chuyển tên chủ sở hữu trong sổ đỏ, sửa đổi nội dung hợp đồng liên doanh để lấy quyền định đoạt khu đất số 7 – 9.
Sau đó, Đinh Ngọc Hệ chỉ đạo Phạm Văn Diệt mang đất đi thế chấp tại ngân hàng BIDV cho các công ty liên quan mình vay 717 tỉ đồng, hiện còn dư nợ hơn 500 tỷ đồng. Vì vậy, HĐXX xác định các bị cáo Hệ, Diệt, Hoan đã gian dối nhằm chiếm đoạt khu đất số 7 - 9 của QCHQ có giá trị tại thời điểm năm 2010 là hơn 525 tỉ đồng.