Tại buổi họp báo thường kỳ của Chính phủ chiều tối 3.8, phóng viên đã đặt câu hỏi về thông tin hồ sơ gốc bổ nhiệm Trịnh Xuân Thanh ở Bộ Nội vụ bị thất lạc, Thứ trưởng Bộ Nội vụ Nguyễn Trọng Thừa cho biết: Bộ Nội vụ có nhận được 2 bộ hồ sơ có dấu đỏ gốc từ tỉnh Hậu Giang đề nghị phê chuẩn chức danh Phó Chủ tịch thì trên cơ sở đó, văn thư Bộ Nội vụ có đóng dấu một bản. Hiện nay, một bản gốc chúng tôi vẫn còn. Thất lạc là ở bản đóng dấu công văn đến. Tuy nhiên, việc này chúng tôi đang phối hợp chặt chẽ với Bộ Công an, kiểm điểm các cá nhân, tổ chức, đơn vị có liên quan. Khi có kết luận sẽ công bố.
Như tin đã đưa, đối tượng Trịnh Xuân Thanh ra đầu thú ngày 31.7.2017. Bắt đầu từ việc phát hiện chiếc xe Lexus 570 trị giá 5 tỉ đồng đeo biển số xanh (biển công) mà Trịnh Xuân Thanh dùng để đi lại khi làm Phó Chủ tịch UBND tỉnh Hậu Giang, báo chí đã vào cuộc điều tra.
Đến ngày 9.6.2016, Văn phòng Trung ương Đảng có công văn thông báo ý kiến chỉ đạo của Tổng Bí thư Nguyễn Phú Trọng giao Ủy ban Kiểm tra T.Ư chủ trì, phối hợp với Ban Nội chính T.Ư, Ban Tổ chức T.Ư, Bộ Công an và các cơ quan khác khẩn trương kiểm tra, xem xét, kết luận những nội dung mà báo chí phản ánh về việc sử dụng xe tư gắn biển xanh và những vấn đề liên quan đến Trịnh Xuân Thanh.
Ngày 16.6.2016, tại phiên họp HĐND tỉnh Hậu Giang, Trịnh Xuân Thanh không xuất hiện trong danh sách giới thiệu đại biểu ứng cử chức danh Phó Chủ tịch UBND tỉnh nhiệm kỳ mới. Trước đó, Trịnh Xuân Thanh đã viết đơn gửi Tỉnh ủy và HĐND tỉnh nhiệm kỳ 2016 – 2021 xin không tái cử chức danh Phó Chủ tịch UBND tỉnh nhiệm kỳ 2016 – 2021.
Tháng 7.2016, Ủy ban Kiểm tra T.Ư đã thông báo kết luận liên quan đến Trịnh Xuân Thanh. Kết luận có nêu: Trong thời gian từ năm 2007-2013, Trịnh Xuân Thanh và Ban Thường vụ Đảng ủy, HĐQT, Ban Tổng giám đốc Tổng Cty PVC đã thiếu trách nhiệm, buông lỏng lãnh đạo, thiếu kiểm tra, giám sát, làm trái các quy định của pháp luật về quản lý kinh tế, để xảy ra nhiều sai phạm và thua lỗ 3.298,27 tỉ đồng (giai đoạn 2011- 2013).
Ngày 15.7.2016, Hội đồng Bầu cử Quốc gia đã họp và nhất trí không xác nhận tư cách Đại biểu Quốc hội khóa XIV của Trịnh Xuân Thanh (Trịnh Xuân Thanh ứng cử và trúng cử tại Hậu Giang).
Ngày 13.9.2016, ông Trần Công Chánh, Bí thư Tỉnh ủy Hậu Giang cho biết, trung tuần tháng 7, nguyên Phó Chủ tịch tỉnh Hậu Giang Trịnh Xuân Thanh có gửi đơn đến Tỉnh ủy xin nghỉ phép từ 25 đến 29.7. Sau đó, ngày 19.8, ông Thanh gửi đơn lần 2 xin nghỉ phép một tháng để đi nước ngoài trị bệnh, từ ngày 3.8 đến 2.9. Dù không được đồng ý nhưng Trịnh Xuân Thanh mất liên lạc, có thông tin cho biết ông này ra nước ngoài chữa bệnh.
Ngày 8.9.2016, Ban Bí thư Trung ương Đảng đã có quyết định kỷ luật khai trừ Trịnh Xuân Thanh khỏi Đảng (trên cơ sở đề nghị của Ủy ban Kiểm tra Trung ương).
Ngày 15.9.2016, Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố vụ án hình sự: Cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng xảy ra tại PVC và các đơn vị thành viên. Đồng thời ra quyết định khởi tố 4 bị can gồm: Vũ Đức Thuận, nguyên Tổng Giám đốc; Nguyễn Mạnh Tiến, Phó tổng Giám đốc; Trương Quốc Dũng, nguyên Phó tổng giám đốc; Phạm Tiến Đạt, nguyên Kế toán trưởng PVC.
Cùng ngày, Bộ Công an cũng ra quyết định khởi tố bị can đối với Trịnh Xuân Thanh. Sau khi xác định đối tượng đã bỏ trốn, Cơ quan CSĐT đã ra quyết định truy nã quốc tế.