Theo đại diện VKS, bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh (54 tuổi, cựu Phó cục trưởng Cục Thuế TP Hồ Chí Minh), là người trực tiếp ký duyệt đề xuất hoàn thuế, quyết định hoàn thuế giá trị gia tăng và 15 lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách cho Thuduc House, gây thất thoát số tiền 331 tỉ đồng.
Tại tòa, bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh thừa nhận hành vi như cáo trạng đã buộc tội. Bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh cho rằng, trong quá trình giải quyết công việc, bị cáo luôn theo lương tâm và trách nhiệm, không có vụ lợi, nên mong HĐXX xem xét.
Cơ quan công tố xác định, Thuduc House không có hoạt động xuất khẩu các mặt hàng là linh kiện điện tử trên thực tế, có số tiền hoàn thuế tăng đột biến, doanh nghiệp bên mua và bán có quan hệ liên kết. Do đó, theo quy định, toàn bộ hồ sơ hoàn thuế phải thuộc diện "kiểm tra trước, hoàn thuế sau". Tuy nhiên, một số cán bộ Cục Thuế TP Hồ Chí Minh đã không tuân thủ quy định của pháp luật về quản lý thuế; không đối chiếu số liệu, báo cáo dấu hiệu bất thường trong các bộ hồ sơ; không tổ chức thanh tra để phát hiện sai phạm, vẫn thực hiện "hoàn thuế trước khi kiểm tra".
Các cán bộ phòng chuyên môn đã phát hiện và có tờ trình về các rủi ro trong quá trình hoàn thuế cho Thuduc House và đề nghị lãnh đạo kiểm tra việc hoàn thuế ngay. Tuy nhiên, gần một năm sau, Cục Thuế TP Hồ Chí Minh mới thành lập đoàn thanh tra và trong thời gian này vẫn tiếp tục hoàn thuế.
Nhà chức trách đánh giá, bị cáo Hạnh biết rõ hồ sơ hoàn thuế của Thuduc House có rủi ro và đã giao cho cấp dưới kiểm tra, nhưng không chờ kết quả mà vẫn duyệt ký các quyết định hoàn thuế gây thất thoát tiền cho nhà nước.
VKS tiếp tục đề nghị mức án đối với các bị cáo khác.
Cáo trạng xác định, từ năm 2017 đến năm 2019, Trịnh Tiến Dũng đã chỉ đạo thành lập nhiều doanh nghiệp ở Việt Nam và nước ngoài để lập hồ sơ, xuất nhập khẩu hàng hóa. Tại Mỹ, Campuchia, Malaysia và UAE, Dũng đã thành lập, sử dụng 13 pháp nhân để ký các hợp đồng xuất nhập khẩu, giao nhận hàng hóa.
Từ tháng 2.2018 đến tháng 6.2019, Trịnh Tiến Dũng chỉ đạo các thuộc cấp móc nối với các nghi phạm tại Thuduc House lập, ký 334 hợp đồng kinh tế với 8 công ty nước ngoài để bán hàng hóa linh kiện điện tử cho các đối tác. Tổng giá trị các lô hàng xuất khẩu là hơn 158 triệu USD (hơn 3.600 tỉ đồng), thuế VAT hàng xuất khẩu bằng 0%.
Để hợp thức hóa đầu vào, Thuduc House đã lập, ký 334 hợp đồng mua bán linh kiện điện tử trong nước với nhiều công ty với giá trị hơn 4.000 tỉ đồng, trong đó có 10% tiền thuế VAT. Sau đó, công ty này lập 17 bộ hồ sơ gửi Cục Thuế TP Hồ Chí Minh đề nghị hoàn thuế VAT hơn 365 tỉ đồng.
Khi tiếp nhận hồ sơ, Cục thuế TP Hồ Chí Minh đã ban hành 17 quyết định hoàn thuế VAT cho Thuduc House với tổng số tiền hơn 365 tỉ đồng.
Hiện Trịnh Tiến Dũng đang bỏ trốn, Cơ quan CSĐT Bộ Công an đã ra Quyết định truy nã và Thông báo truy nã quốc tế Interpol đối với đối tượng này, tạm đình chỉ điều tra vụ án đối với kẻ cầm đầu vụ án, khi nào bắt được Trịnh Tiến Dũng sẽ phục hồi điều tra và xử lý.