67 bị cáo bị truy tố về các tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, "Sản xuất buôn bán hàng giả”, "Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”, “Vận chuyển trái phép hàng hóa, tiền tệ qua biên giới”, “Vi phạm quy định về quản lý tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí”; “Buôn Lậu”, "Nhận hối Lộ”, “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”, “Sử dụng tài liệu giả của cơ quan tổ chức”; "Làm giả tài liệu của cơ quan tổ chức”.

Trong số các bị cáo bị truy tố có nhiều cựu lãnh đạo, cán bộ của Cục Thuế TP Hồ Chí Minh như: Nguyễn Thị Bích Hạnh (cựu Phó Cục trưởng Cục Thuế TP Hồ Chí Minh); Phạm Minh Tuấn (cựu Trưởng phòng Kê khai kế toán thuế); Cao Văn Tỵ (cựu Trưởng phòng Thanh tra kiểm tra thuế số 5); Nguyễn Xuân Thắng (cựu Trưởng phòng Kiểm tra nội bộ); Đào Thị Nga (cán bộ Chi Cục thuế quận 1), Nguyễn Phương Nam (cán bộ Chi Cục thuế quận 3); Ngô Huỳnh Lũy (cán bộ Chi Cục thuế quận 5)…

7 người thuộc Cục hải quan TP Hồ Chí Minh bị truy tố gồm Phạm Duy Bình, Hoàng Trung Kiên, Hồ Hoàng Hải, Nguyễn Duy Linh, Trần Văn Thành, Nguyễn Hữu Trên và Nguyễn Lê Hùng.

Hội đồng xét xử xác định Cục thuế TP Hồ Chí Minh, Thuduc House là bị hại và đã triệu tập đại diện 2 cơ quan này tham gia phiên tòa. Đồng thời, triệu tập Hội đồng định giá trong tố tụng hình sự TP Hồ Chí Minh, gần 250 người có quyền và nghĩa vụ liên quan, 55 luật sư tham gia phiên xét xử.

Theo cáo trạng, từ năm 2016 - 2020, đối tượng Trịnh Tiến Dũng (đang trốn truy nã) với vai trò là chủ mưu cầm đầu, chỉ đạo các đồng phạm dùng thủ đoạn gian dối thông qua sản xuất, sử dụng hàng giả, hàng nhái, hàng đã qua sử dụng thực hiện việc mua bán hàng hóa lòng vòng, nâng giá lên nhiều lần, sử dụng giấy tờ giả, giấy tờ không hợp pháp của cơ quan Nhà nước vào việc thành lập, sử dụng các công ty “ma”; thực hiện các thủ tục mua bán, xuất khẩu hàng hóa, lập hồ sơ để các công ty như Thuduc House, Sài Gòn Tây Nam và Hoàng Nam Anh mua linh kiện điện tử của các công ty do ông Dũng thành lập...

Sau khi nhận được tiền từ các công ty Thuduc House, Sài Gòn Tây Nam và Hoàng Nam Anh, ông Trịnh Tiến Dũng đã chỉ đạo chuyển tiền lòng vòng vào các tài khoản của tổ chức, cá nhân, rút toàn bộ 538 tỉ đồng tiền thuế giá trị gia tăng để chiếm đoạt.

Bị cáo Nguyễn Thị Bích Hạnh (cựu Phó Cục trưởng Cục thuế TP Hồ Chí Minh) đã trực tiếp ký duyệt đề xuất hoàn thuế, quyết định hoàn thuế giá trị gia tăng và 15 lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách cho Thuduc House, gây thất thoát số tiền 331 tỉ đồng.

Ngoài ra, 3 bị cáo là Đào Thị Nga (cựu cán bộ Chi cục thuế quận 1), Nguyễn Phương Nam (cựu cán bộ Chi cục thuế quận 3) và Ngô Huỳnh Lũy (cựu cán bộ Chi cục thuế quận 5) đã nhận hối lộ trên 7,3 tỉ đồng.

Vụ án còn có 7 cán bộ hải quan Cửa khẩu cảng Sài Gòn khu vực I (thuộc Hải quan TP Hồ Chí Minh), đã không thực hiện đúng nhiệm vụ được giao, cập nhật thông tin lên hệ thống để thông quan cho các lô hàng và không phát hiện được hành vi buôn lậu của Trịnh Tiến Dũng và đồng phạm.