Theo rà soát, Công ty Hào Hùng (do Lê Khánh Hào, trú khối 10, thị trấn Phố Châu, huyện Hương Sơn làm giám đốc) từ năm 2011 đến năm 2015 đã thực hiện 23 kỳ hoàn thuế với số tiền 59,5 tỷ đồng với nhiều biểu hiện nghi vấn gian lận nên Công an đã thu thập hồ sơ, tài liệu và các thông tin có liên quan đến hoạt động xuất nhập khẩu hàng hóa của Công ty này.
Qua xác minh, Lê Khánh Hào đứng tên Công ty Hào Hùng với chức vụ giám đốc, nhưng thực tế mọi hoạt động của Công ty đều do Hậu điều hành. Lợi dụng chính sách về hoàn thuế giá trị gia tăng cho hoạt động xuất khẩu hàng hóa, Hoàng Thị Hậu đã có các thủ đoạn gian dối như mượn hàng của các chủ hàng, chủ xe để làm thủ tục xuất khẩu, mở tờ khai hàng hóa xuất khẩu qua các cửa khẩu; mua hóa đơn giá trị gia tăng của nhiều công ty trong cả nước để hợp thức hàng hóa đầu vào; Sau đó hoàn thiện hồ sơ để hoàn thuế.
Căn cứ vào các tài liệu và chứng cứ thu thập được, bước đầu Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Hà Tĩnh xác định: Từ năm 2013 đến năm 2015, Công ty Hào Hùng đã sử dụng hơn 1000 hóa đơn giá trị gia tăng mua hàng của gần 100 Công ty ma trên cả nước (Hải phòng, Bắc Ninh, Ninh Bình, Hà Nam, Thanh Hóa, Nghệ An, Đà Nẵng, Quảng Bình, Bình Dương, Thành phố Hồ Chí Minh…) để kê khai, quyết toán và hoàn thuế tại Cục thuế tỉnh Hà Tĩnh, hàng hóa chủ yếu của số hóa đơn này là vật liệu xây dựng (Xi măng, sắt, thép…). sau đó lập hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng để chiếm đoạt tiền hoàn thuế của Nhà nước hàng chục tỷ đồng.