Trong số 27 bị cáo truy tố trước tòa, có 13 bị cáo nguyên là cán bộ công tác tại Cục Hải quan An Giang (HQAG) và Cục thuế tỉnh An Giang (TAG) (6 bị cáo cáo nguyên là cán bộ Cục TAG gồm Lương Huỳnh Long, Võ Văn Ngoan, Trần Thanh Tâm, Mai Anh Tuấn, Lê Thị Kim Oanh, Dương Hoàng Yến; 7 bị cáo nguyên là cán bộ Cục HQAG gồm: Thái Sơn Hải, Trần Quốc Thắng, Nguyễn Khắc Duyên, Lê Văn Chồi, Nguyễn Hữu Hoàng, Đinh Hồng Lĩnh, Lâm Quang Thiện) cùng bị truy tố về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.
Cụ thể, các bị cáo: Phạm Thanh Dũng 16 năm tù; Nguyễn Dân An 12 năm tù; Lê Thị Kim Anh 7 năm tù; Mai Chí Dũng 7 năm tù; Trần Thanh Bình 7 năm tù; Nguyễn Minh Hiếu 12 năm tù, cùng về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”.
Các bị cáo: Đỗ Thanh Như 3 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 5 năm; Tô Hoàng Minh Thông 3 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 5 năm; Trương Văn Danh 1 năm 5 tháng 1 ngày tù; Ngô Thị Hồng Loan 1 năm 6 tháng tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 3 năm; Tạ Mỹ Linh 1 năm 1 tháng 10 ngày tù; Hà Thanh Trúc 1 năm tù; Bùi Thị Thủy 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Bùi Thị Bích Thảo 1 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 2 năm, cùng về tội “Mua bán trái phép hóa đơn thu nộp ngân sách Nhà nước”.
Các bị cáo: Thái Sơn Hải 2 năm 8 tháng 14 ngày tù; Trần Quốc Thắng 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Nguyễn Khắc Duyên 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Lê Văn Chồi 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Nguyễn Hữu Hoàng 2 năm 5 tháng tù; Đinh Hồng Lĩnh 2 năm 5 tháng tù; Lâm Quang Thiện 2 năm 5 tháng tù; Võ Văn Ngoan 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Trần Thanh Tâm 3 năm 2 tháng tù; Mai Anh Tuấn 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Lê Thị Kim Oanh 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm; Dương Hoàng Yến 2 năm tù, cho hưởng án treo, thời gian thử thách 4 năm, cùng về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.
Theo cáo trạng, lợi dụng chính sách hoàn thuế GTGT của Nhà nước, từ tháng 12.2010 đến tháng 12.2013, Phạm Thanh Dũng đã có hành vi gian dối sử dụng pháp nhân của Cty Tân Thành Lợi, Tân Thành Lợi An Phú, Tân Thành Lợi Kim để trực tiếp mua hoặc chỉ đạo Lê Thị Kim Anh, Nguyễn Dân An mua 1.875 hóa đơn GTGT khống và sử dụng các Cty của mình xuất hóa đơn quay vòng, để tạo chứng từ, hồ sơ giả mua bán hàng trong nước, hợp thức đầu vào, móc nối làm giả hợp đồng mua bán ngoại thương...
Sau đó chỉ đạo Mai Chí Dũng, Trần Thanh Bình, Nguyễn Minh Hiếu nhiều lần làm giả hồ sơ xuất khẩu, chứng từ thanh toán hàng hóa bán ra, tạo dựng 42 bộ hồ sơ xin hoàn thuế GTGT. Được sự tiếp tay, giúp sức của một số cán bộ Hải quan cửa khẩu Bắc Đai, Khánh Bình, Chi Cục Thuế huyện An Phú, Cục TAG làm trái công vụ, Phạm Thanh Dũng đã lừa đảo chiếm đoạt 35,68 tỷ đồng tiền ngân sách Nhà nước.