Nhiều cán bộ đại diện Cục Quản lý Dược tham gia trả lời các câu hỏi của HĐXX. Đại diện Cục Quản lý Dược cho rằng, có hồ sơ nộp đúng quy định. Vị đại diện này viện dẫn các quy định, thông tư để trả lời HĐXX về giá thuốc khi các câu hỏi xoáy quanh các loại thuốc (7 loại) mà Cục đã cấp phép trước đó.
Theo đại diện Cục Quản lý Dược, 7 sản phẩm thuốc được cấp ngày 12.6.2014, các giấy tờ không đúng nên không cấp giấy phép, nên rút không cấp phép. HĐXX hỏi có phải vì xảy ra vụ án nên Cục Quản lý Dược biết là thuốc giả, giấy tờ giả nên rút không cấp phép? Đại diện Cục Quản lý Dược cho rằng, khi phát hiện có vấn đề thì phải xử lý theo quy định.
Trước câu hỏi về quy trình xem xét nhập thuốc, nguồn gốc thuốc, Cục Quản lý Dược cho rằng dựa vào hợp pháp hóa lãnh sự, ngoài các pháp lý kỹ càng, còn có hai cơ quan thẩm định việc này. Lúc này, HĐXX hỏi nguồn gốc thuốc có quan trọng không, thì đại diện Cục Quản lý Dược cho rằng có nhiều cơ quan cũng như hợp pháp hóa lãnh sự làm việc này nên rất cẩn trọng.
Chủ tọa hỏi đại diện Cục Quản lý Dược là trong vụ án này, Cục cấp phép nhập khẩu lô thuốc của VN Pharma có đúng không? Đại diện Cục Quản lý Dược cho rằng là đúng.
Công tố tại phiên tòa hỏi đại diện Cục Quản lý Dược rằng Cục có sai sót gì trong vụ án VN Pharma? Trách nhiệm người đứng đầu Cục Quản lý Dược? Đại diện Cục Quản lý Dược nại rằng sẽ trả lời bằng văn bản sau này.
Về việc với các nhóm thẩm định hồ sơ của Cục Quản lý Dược, tại sao là những chuyên gia về y tế, hồ sơ đạt cũng được mà không đạt cũng không có ý kiến gì? Lúc này vị đại diện Cục Quản lý Dược lại cho rằng mình không tham gia nên không biết.
VKS hỏi Cục Quản lý Dược nhận đơn đặt hàng của VN Pharma vào ngày nào? Đại diện Cục ấp úng, thì VKS công bố ngày nộp đó 30.10.2013.
Cty bán thuốc cho VN Pharma là Cty nước ngoài nhưng ngày hết hạn trên giấy phép hoạt động tại Việt Nam là ngày 6.10.2013. Vậy tại sao Cục Quản lý Dược vẫn xét duyệt hồ sơ cho VN Pharma mua thuốc? Lúc này đại diện Cục cho rằng phải dựa trên giấy phép trên lãnh thổ Việt Nam. VKS liền nêu câu hỏi, giấy phép hết hạn đã gần một tháng, vì sao Cục vẫn xét duyệt đơn mua thuốc của VN Pharma?