Kết quả điều tra vụ án, C03 xác định: Năm 2020, 2021, tổng doanh thu của Công ty Việt Á là hơn 4.200 tỉ đồng. Trong đó, Việt Á đã sản xuất tổng số hơn 8,77 triệu kit xét nghiệm, tiêu thụ (bán, cho/tặng, ứng trước) cho các đơn vị, cơ sở y tế hơn 8,36 triệu test. Số tiền thanh toán hơn 5,9 triệu kit xét nghiệm là hơn 2.200 tỉ đồng.
Do đó, C03 khởi tố điều tra về việc Phan Quốc Việt và đồng phạm "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" trong quá trình Công ty Việt Á tiêu thụ 679.616 kit xét nghiệm tại CDC các tỉnh Hải Dương, Bắc Giang, Nghệ An, Bình Dương, gây thiệt hại tài sản Nhà nước hơn 222 tỉ đồng.
Còn Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an các tỉnh, thành phố tổ chức điều tra làm rõ việc Công ty Việt Á tiêu thụ kit xét nghiệm tại các đơn vị, cơ sở y tể công lập khác trên địa bàn cả nước.
Theo kết luận, đến nay, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an 15 tỉnh/thành phố đã khởi tố 15 vụ án về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng", với tổng số 597.727 kit xét nghiêm, gây thiệt hại tài sản Nhà nước hơn 180 tỉ đồng.
"Như vậy, Phan Quốc Việt và đồng phạm gây thiệt hại tài sản Nhà nước tổng cộng hơn 420 tỉ đồng", kết luận nêu.
Quá trình điều tra, C03 đã ra quyết định tổ chức thực nghiệm việc sản xuất kit xét nghiệm COVID-19 của Công ty Việt Á.
Ngày 9.3.2022, C03 đã kiểm tra hiện trường về máy móc, thiết bị, mặt bằng sản xuất, nhân công và tổ chức thực nghiệm tại Phòng Sản xuất kit xét nghiệm của Công ty Việt Á, có sự tham gia của luật sư bào chữa cho Phan Quốc Việt và đại diện Cục Khoa học Hình sự Bộ Công an; Chính quyền TP Dĩ An, tỉnh Bình Dương; các cơ quan chuyên môn thuộc Bộ Y tế (Viện Kiểm định Quốc gia vaccine và Sinh phẩm y tế, Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế, Thanh tra Bộ Y tế, Cục Khoa học Công nghệ và Đào tạo, Viện Pasteur TP Hồ Chí Minh).
Những người tham gia thực nghiệm điều tra gồm 13 nhân viên Công ty Việt Á gồm: bà Hồ Thị Thanh Thủy - Phó Tổng Giám đốc phụ trách sản xuất; 9 nhân viên Phòng Sản xuất; 2 nhân viên Phòng Kiểm tra chất lượng.
Những người tiến hành thực nghiệm chuẩn bị nguyên liệu, phương tiện máy móc gồm 11 loại hóa chất và 16 loại phương tiện, máy móc phục vụ thực nghiệm để sản xuất 1 lô gồm 2.500 kit xét nghiệm COVID-19 theo quy trình đầy đủ mà Công ty Việt Á đã thực hiện, trong điều kiện sản xuất bình thường của Công ty Việt Á.
Sau đó, tổ chức cho những người tham gia tiến hành lại toàn bộ quá trình sản xuất ra 1 lô kit xét nghiệm COVID-19 và tiến hành kiểm tra chất lượng sản phẩm. Kết quả thực nghiệm điều tra: Tổng thời gian 2h5' đã sản xuất được 2.432 kit xét nghiệm.
Tiếp đó, ngày 29.3.2022, C03 ra Quyết định trưng cầu giám định trưng cầu Bộ Y tế giám định thành phần hoá học, cấu trúc, mẫu dò, tính năng, công dụng, hiệu quả kit xét nghiệm... (đối với mẫu test xét nghiệm khi thực nghiệm điều tra và kit xét nghiệm thu giữ tại CDC Hải Dương).
Hội đồng giám định tư pháp có Kết luận về thành phần hoá học, cấu trúc, mẫu dò, tính năng, công dụng, hiệu quả của kit xét nghiệm, đảm bảo 4 tiêu chí: Giới hạn phát hiện, độ nhạy, độ đặc hiệu, độ chính xác, phù hợp với hồ sơ cấp sổ đăng ký lưu hành của Bộ Y tế.
Mặt khác, C03 cũng làm rõ, trong các năm 2020, 2021, tổng số tiền Công ty Việt Á đã chi để mua 11 hoá chất hơn 386 tỉ đồng, tổng giá trị hoá chất tồn kho là hơn 21 tỉ đồng.
Tổng số tiền Công ty Việt Á đã thực chi để mua 11 hoá chất phục vụ sản xuất kit xét nghiệm là gần 365 tỉ đồng. Như vậy, chi phí nguyên vật liệu trực tiếp (11 loại hoá chất) để sản xuất 1 kit xét nghiệm là 41.557 đồng.
Theo đó, C03 xác định giá thành sản xuất kit xét nghiệm của Công ty Việt Á trong năm 2020 và năm 2021 (đã bao gồm toàn bộ chi phí hợp lý, hợp lệ và lợi nhuận định mức 5% theo quy định) tối đa là 143.461 đồng/test.