Trước đó, Chủ tịch UBND TPHCM là ông Nguyễn Thành Phong ký quyết định kỷ luật ông Hùng ở mức khiển trách.
Xung quanh kết quả kiểm toán Nhà nước và kết luận thanh tra của TPHCM về sai phạm ở Sagri, tại buổi họp báo chiều 1.10.2018, ông Võ Văn Hoan - Chánh VP UBND TPHCM cho biết, kết luận trước đây của Thanh tra TP chưa chỉ ra hết sai phạm. Sau khi kiểm toán vào cuộc thì sai phạm rõ hơn, do có chuyên môn đặc biệt về nghiệp vụ kế toán.
Theo đó, sai phạm lớn, trọng tâm ở Sagri được xác định là cho thuê đất, hợp tác đầu tư trái thẩm quyền, đầu tư kinh doanh ngoài ngành; sai phạm trong quản lý điều hành.
Sau khi tiếp nhận báo cáo của kiểm toán nhà nước, thành phố đã chỉ đạo Thanh tra TP xem xét và có ý kiến tiếp tục làm rõ thêm sai phạm, trách nhiệm hay không và làm như thế nào.
Theo ông Hoan, UBND TPHCM cũng không đồng ý với mức kỷ luật ông Lê Tấn Hùng trước đó, và đã chỉ đạo các bên liên quan xem xét lại mức kỷ luật đối với lãnh đạo Sagri.
Trước đó, tháng 3.2018, Chủ tịch UBND TP HCM Nguyễn Thành Phong đã ra quyết định kỷ luật đối với người quản lý Sagri.
Theo đó, ông Lê Tấn Hùng - thành viên không chuyên trách Hội đồng thành viên, Tổng Giám đốc Sagri bị kỷ luật bằng hình thức khiển trách do có hành vi vi phạm về nguyên tắc kế toán được quy định tại khoản 4, Điều 6 Luật Kế toán năm 2003.
Bà Nguyễn Thị Thúy - kế toán trưởng Sagri cũng bị kỷ luật bằng hình thức khiển trách do có hành vi vi phạm về nguyên tắc kế toán.