Về công tác nhập cảnh, các đoàn thể thao Đông Nam Á (bao gồm quan chức, trọng tài, vận động viên, thành viên) khi sang Việt Nam tham dự SEA Games phải đảm bảo có kết quả xét nghiệm âm tính với SARS-CoV-2 bằng phương pháp RT-PCR/RT-LAMP trong vòng 72 giờ hoặc xét nghiệm kháng nguyên nhanh SARS-CoV-2 trong vòng 24 giờ trước khi nhập cảnh vào Việt Nam và có chứng nhận xét nghiệm do cơ quan có thẩm quyền của quốc gia thực hiện xét nghiệm cấp.
Đối với khách mời cấp Thứ trưởng và tương đương trở lên, Trưởng, Phó trưởng đoàn thể thao tham dự SEA Games 31 thì không bắt buộc phải có giấy xác nhận SARS-CoV-2 âm tính; sau khi nhập cảnh không phải xét nghiệm COVID-19.
Theo quy định, các đoàn vận động viên sẽ hoạt động theo cơ chế "khép kín" trong quá trình tham dự Đại hội, tức là di chuyển từ nơi lưu trú - sân tập, điểm tập luyện, nơi thi đấu, sân vận động - nơi lưu trú. Tổ chức việc đưa đón bằng phương tiện riêng đảm bảo các yêu cầu phòng, chống dịch COVID-19.
Liên quan đến công tác tổ chức thi đấu, ban tổ chức phải đảm bảo phân chia khu vực rõ ràng và kiểm soát ra vào nghiêm túc để giảm thiểu tối đa việc tiếp xúc giữa các nhóm khác nhau. Tại các thời điểm, số lượng nhân viên trong mỗi khu vực phải được giữ ở mức tối thiểu theo yêu cầu.
Bên cạnh đó, trong quá trình thi đấu, vận động viên, trọng tài không phải đeo khẩu trang; các thành viên khác thực hiện đeo khẩu trang liên tục. Hạn chế đến mức tối đa việc bố trí khách VIP vào bắt tay động viên vận động viên trước khi thi đấu.
Ngoài ra, các vận động viên, thành viên trong đoàn thể thao cần tránh giao tiếp (bắt tay) tối đa; tránh nhổ nước bọt trên sân, sàn thi đấu; tránh chia sẻ vật dụng cá nhân; mỗi cá nhân sử dụng chai nước riêng; hạn chế giao tiếp khi ăn mừng chiến thắng, ghi bàn thắng...
Các vận động viên nếu mắc COVID-19 sẽ được cách ly tại phòng riêng và có sự theo dõi của cơ sở y tế địa phương. Trong trường hợp các đoàn thể thao có thành viên mắc COVID-19 phải nhập viện điều trị, sẽ tự trả tiền viện phí cho cơ sở điều trị đó.
Đặc biệt, Bộ Y tế cho phép các đoàn thể thao được mang theo các thiết bị y tế không thuộc danh mục cấm nhập vào Việt Nam, nhưng thông báo trước cho Ban tổ chức nước chủ nhà.