Đoàn thể thao Việt Nam bay trên chuyến bay mang mã số JL 752, cất cánh lúc 23hh20 ngày 18.7 và hạ cánh lúc 6h00 ngày 19.7 tại sân bay quốc tế Narita, Nhật Bản (giờ địa phương).
Vào giờ chiều ngày 18.7, các thành viên của đoàn thể thao Việt Nam ở khu vực phía Nam bay ra sân bay Nội Bài để gia nhập đoàn chính. Đến 20h30 tất cả các thành viên của đoàn thể thao Việt Nam đã có mặt tại sân bay để làm thủ tục lên máy bay.
Bà Lê Thị Hoàng Yến - Phó Tổng cục trưởng Tổng cục Thể dục Thể thao đã có mặt tại sân bay Nội Bài để tiễn đoàn. Đoàn thể thao Việt Nam dự Olympic Tokyo 2020 do ông Trần Đức Phấn - Phó Tổng cục trưởng phụ trách Tổng cục Thể dục Thể thao làm trưởng đoàn gồm 43 thành viên, trong đó 7 cán bộ, 18 vận động viên, 8 huấn luyện viên, 6 chuyên gia, 2 bác sỹ, 1 phóng viên tranh tài ở 11 môn thể thao.
Dù lãnh đạo Bộ Văn hoá Thể thao và Du lịch không giao chỉ tiêu nhưng đoàn đăng ký với Bộ sẽ cố gắng phấn đấu có huy chương.
Các thành viên của đoàn thể thao Việt Nam khi xuống sân bay Narita sẽ được test COVID-19. Và nếu kết quả là âm tính, toàn đoàn sẽ được xe chuyên dụng của ban tổ chức đưa đi cách ly. Trong suốt quá trình thi đấu tại thế vận hội, toàn đoàn sẽ không được tiếp xúc với các đối tượng nằm ngoài quy định của nguyên tắc “bong bóng”.