Ông Nguyễn Thanh Long (sinh năm 1966, quê Nam Định) là tiến sĩ y học, trải qua nhiều cương vị tại Bộ Y tế trước khi làm Cục trưởng Phòng chống HIV/AIDS. Ông từng đảm nhiệm chức Thứ trưởng Y tế từ tháng 12.2011. Tháng 10.2018, ông được điều động làm Phó ban Tuyên giáo Trung ương. Ông được bổ nhiệm trở lại làm Thứ trưởng Y tế từ tháng 1.2020.
Tháng 11.2019, Quốc hội đã miễn nhiệm Bộ trưởng Y tế Nguyễn Thị Kim Tiến. Bộ Chính trị trước đó đã quyết định bổ nhiệm bà Nguyễn Thị Kim Tiến làm Trưởng Ban Bảo vệ, chăm sóc sức khoẻ cán bộ Trung ương thay ông Nguyễn Quốc Triệu.
Chính phủ đã phân công Phó Thủ tướng Vũ Đức Đam phụ trách Bí thư ban cán sự Đảng Bộ Y tế và phân công phụ trách toàn diện Bộ Y tế.
Hiện Bộ Y tế có 4 thứ trưởng, gồm các ông: Trương Quốc Cường, Nguyễn Trường Sơn, Đỗ Xuân Tuyên, Trần Văn Thuấn.