Theo tìm hiểu của phóng viên, khoảng giữa năm 2011, tại trụ sở Liên hiệp Các hội khoa học - kỹ thuật tỉnh Bình Phước đã diễn ra hội thảo cho ông Võ Hoàng Yên khám chữa bệnh để kiểm chứng tay nghề.
Lúc này, ông Võ Hoàng Yên đã chữa bằng phương pháp xoa bóp day ấn huyệt cho 2 bệnh nhân bị điếc, 2 người bị tai biến mạch máu não liệt nửa người và 2 người thoái hóa cột sống. Kết quả, các bệnh nhân có biến chuyển nhẹ nhưng không khỏi.
Tuy nhiên, ngày 3.3.2021, ông Quách Ái Đức - Giám đốc Sở Y tế tỉnh Bình Phước xác nhận với phóng viên Báo Lao Động về việc hồ sơ của ông Võ Hoàng Yên chưa đầy đủ, nên Sở chưa cấp phép hoạt động hành nghề khám chữa bệnh trên địa bàn đối với ông Yên. Nếu ông Võ Hoàng Yên tổ chức khám chữa bệnh trên địa bàn tỉnh Bình Phước là không đúng quy định của pháp luật.
Liên quan đến dự án xây dựng Trung tâm Khám chữa bệnh và Phòng thuốc nam Phước Thiện (ở huyện Chơn Thành, tỉnh Bình Phước) giữa ông Huỳnh Uy Dũng (hay còn gọi là ông Dũng "lò vôi") và ông Võ Hoàng Yên, ông Huỳnh Uy Dũng cho biết đó mới chỉ là dự kiến.
Được biết vào tháng 10.2019, ông Huỳnh Uy Dũng cùng ông Võ Hoàng Yên đến động thổ xây dựng cơ sở làm Trung tâm Khám chữa bệnh và Phòng thuốc nam Phước Thiện. Nơi này dự kiến để ông Võ Hoàng Yên khám chữa miễn phí bệnh câm điếc cho người nghèo ở Bình Phước.
Tuy nhiên, trao đổi với phóng viên ngày 3.3, ông Huỳnh Uy Dũng cho biết, sau đó ông Yên không dám làm, nói không còn sức lực. Vì vậy, ông Dũng đã thu hồi lại đất đai, không thực hiện mở trung tâm khám chữa bệnh tại đây nữa.
Tối 1.3.2021, bà Nguyễn Phương Hằng (vợ ông Huỳnh Uy Dũng) đã có bài đăng trên mạng xã hội cho rằng ông Võ Hoàng Yên đã có hành vi ăn chặn tiền cứu trợ và xây chùa của vợ chồng mình.
Theo bà Hằng, trong thời gian dài, bà đã tài trợ cho ông Yên để đóng góp xây chùa Hưng An Tự tại huyện Tánh Linh, tỉnh Bình Thuận. Ngoài ra, trong quá trình xây chùa, bà cũng còn gửi cho cá nhân ông Yên 3,8 tỉ đồng để đi cứu trợ lũ lụt ở miền Trung. "Tuy nhiên sau này, trong báo cáo tổng kết hoạt động hỗ trợ lũ lụt thì chỉ sử dụng khoảng 300 triệu đồng hỗ trợ người dân, còn lại toàn bộ số tiền này ông Yên bỏ túi riêng của mình"- bà Hằng tố cáo. Ngoài ra, bà Hằng cho biết còn chuyển nhiều khoản tiền lớn khác để trả nợ cho ông Yên trong quá trình làm việc thiện. Tuy nhiên, số tiền này đã gửi vào tài khoản của người thân ông Yên...
Ngày 2.3.2021, tại Tổ đình Hưng Minh tự (quận 6, TPHCM), đại diện Trung ương Tịnh độ cư sĩ Phật hội Việt Nam đã có buổi làm việc với vợ chồng ông Huỳnh Uy Dũng, bà Nguyễn Phương Hằng cùng ông Võ Hoàng Yên. Tại buổi gặp gỡ này, ông Võ Hoàng Yên phủ nhận những cáo buộc mà bà Hằng đã tố cáo mình.
Tại buổi làm việc, các bên liên quan đã thống nhất sẽ đưa sự việc đến cơ quan công an nhằm làm rõ các vấn đề về quản lý và sử dụng tiền từ thiện của ông Võ Hoàng Yên.