Các hạng mục thuộc phạm vi của cơ sở bao gồm: 02 hầm đơn chạy song song: Hầm Hải Vân 1, chiều dài 6,28 km; hầm Hải Vân 2, chiều dài 6,292 km; Đường dẫn phía Bắc (gồm cả các cầu trên tuyến), chiều dài 1,23 km; Đường dẫn phía Nam (gồm cả các cầu trên tuyến), đoạn Hải Vân - Túy Loan có chiều dài 4,26 km, đoạn Tạ Quang Bửu có chiều dài 1,76 km; Đoạn tuyến Quốc lộ 1 qua đèo Hải Vân, chiều dài 23,6 km.
Quảng trường phía Bắc, diện tích 5.500 m2 (gồm: Nhà trực, nhà để xe cứu hoả - cứu hộ, các công trình phụ trợ...) thuộc thị trấn Lăng Cô, huyện Phú Lộc, tỉnh Thừa Thiên Huế.
Quảng trường phía Nam, diện tích 12.500 m2 (gồm: Trung tâm điều hành, nhà bảo dưỡng phương tiện, các công trình phụ trợ ...) thuộc phường Hoà Hiệp Bắc, quận Liên Chiểu, thành phố Đà Nẵng.
Theo nội dung cấp phép, cơ sở phải vận hành thường xuyên, đúng quy trình các công trình xử lý chất thải bảo đảm chất thải sau xử lý đạt quy chuẩn kỹ thuật môi trường; có biện pháp giảm thiểu tiếng ồn, độ rung đáp ứng yêu cầu bảo vệ môi trường; quản lý chất thải theo quy định của pháp luật. Chịu trách nhiệm trước pháp luật khi chất ô nhiễm không đạt yêu cầu cho phép tại Giấy phép môi trường này và phải dừng ngay việc xả nước thải để thực hiện các biện pháp khắc phục theo quy định của pháp luật.
Nước thải sinh hoạt (có bể tự hoại) từ khu nhà phụ trợ phía Bắc (nguồn số 01) và nước thải vệ sinh hầm khu vực phía Bắc (nguồn số 02) được thu gom về hệ thống xử lý nước thải vệ sinh hầm khu vực phía Bắc (công suất 100 m3/ngày) để xử lý.
Nước thải vệ sinh hầm khu vực phía Nam (nguồn số 03) được thu gom về hệ thống xử lý nước thải vệ sinh hầm khu vực phía Nam (công suất 60 m3/ngày) để xử lý.
Nước thải sinh hoạt (có bể tự hoại), khu nhà ăn (có bể tách dầu mỡ) từ khu văn phòng phía Nam (nguồn số 04) được thu gom về hệ thống xử lý nước thải sinh hoạt khu vực phía Nam để xử lý.
Bộ này yêu cầu cơ sở trang bị các thiết bị dự phòng để thay thế kịp thời khi xảy ra sự cố đối với các hệ thống xử lý nước thải. Thường xuyên giám sát để kịp thời phát hiện và xử lý sự cố nhằm hạn chế tới mức tối đa nước thải chưa được xử lý đạt yêu cầu xả ra môi trường. Thực hiện công tác duy tu, bảo dưỡng, sửa chữa máy móc, thiết bị, đảm bảo máy móc thiết bị hoạt động tốt.
Trường hợp chất lượng nước thải sau xử lý không đáp ứng yêu cầu, phải dừng ngay việc xả nước thải ra môi trường; kiểm tra tìm kiếm lỗi phát sinh từ hệ thống, thiết bị để thay thế, sửa chữa kịp thời. Sau khi khắc phục xong sự cố, vận hành lại hệ thống xử lý nước thải, bảo đảm hệ thống vận hành ổn định (lấy mẫu phân tích các thông số ô nhiễm cho đến khi đạt yêu cầu) mới tiếp tục xả nước thải ra nguồn nước tiếp nhận.