Các thuyền viên trên tàu đã thử mọi biện pháp nhưng không thể khắc phục được sự cố, trong khi cơn bão số 12 đang liên tục quần thảo trên vùng biển Trường Sa và tiến gần về phía đất liền.
Thuyền trưởng đề nghị cứu nạn khẩn cấp đến Trung tâm Phối hợp tìm kiếm cứu nạn hàng hải Việt Nam, tàu đang trong tình trạng hư hỏng, thời tiết tại khu vực rất xấu, biển động dữ dội khiến sức khỏe thuyền viên suy sụp, tinh thần cực kỳ hoảng loạn.
Ngay sau đó, trung tâm đã điều động tàu tìm kiếm cứu nạn chuyên dụng SAR 274 đang túc trực tại Nha Trang ngay lập tức lên đường ứng cứu thuyền viên BĐ 98079 TS.
Trong tình thế khẩn cấp tàu bị nạn đang trong vùng nguy hiểm của bão, tính mạng 13 ngư dân rất nguy cấp thuyền viên tàu SAR 274 được lệnh chạy hết tốc lực về phía tàu bị nạn, chạy đua với bão để tiếp cận và cứu ngư dân.
Gần 10 giờ vượt biển ngược hướng di chuyển của bão trong điều kiện thời tiết đặc biệt nguy hiểm, biển động dữ dội, đến 12 giờ 45 ngày 03.11, lực lượng cứu nạn tiếp cận được tàu BĐ 98079 TS. Sau nỗ lực bơm hút chống nước vào tàu nhưng thời tiết xấu, gió cấp 7,8 giật cấp 10, sóng cao 3-4m, tàu BĐ 98079 TS không thể sữa chữa.
Toàn bọ 13 thuyền viên được chăm sóc y tế và chuyển sang tàu SAR 274 nhanh chóng trở lại đất liền trước khi bão ập tới.