Theo Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên, qua kiểm tra trong thời gian 1996 - 1997, ông Phạm Ngọc Thanh đã thiếu trung thực, không gương mẫu khi kê khai trình độ chuyên môn nghiệp vụ là Đại học Tài chính - Kế toán trong hồ sơ, lý lịch đảng viên, công chức, trong lúc chưa được cấp bằng tốt nghiệp đại học.
Mặc dù biết bản thân không đủ tiêu chuẩn về trình độ chuyên môn theo quy định nhưng ông Thanh vẫn tham gia ứng cử, nhận đề cử để được bầu giữ các chức vụ chủ chốt trong các tổ chức đoàn thể, cấp ủy, bổ nhiệm chức vụ lãnh đạo chính quyền địa phương, vi phạm các quy định của Đảng, Nhà nước.
Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên đã quyết định thi hành kỷ luật đối với ông Lê Văn Tiến Dũng, Huyện ủy viên, Bí thư Đảng ủy, Bí thư Chi bộ Quân sự thị trấn Chí Thạnh, huyện Tuy An bằng hình thức cảnh cáo.
Theo kết quả kiểm tra, trong thời gian giữ chức vụ Huyện ủy viên, Bí thư Đảng ủy xã An Mỹ, Trưởng Phòng Văn hóa - Thông tin huyện Tuy An giai đoạn 2008-2009, ông Lê Văn Tiến Dũng đã thiếu trung thực trong việc kê khai nguồn gốc sử dụng đất, biết gia đình mình không thuộc đối tượng Nhà nước giao đất rừng sản xuất, nhưng vẫn kê khai để được Ủy ban nhân dân huyện Tuy An cấp 3 Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất/tổng diện tích hơn 125.000m2, không đúng quy định của Luật Đất đai.
Ngoài ra, từ năm 2014 đến tháng 3.2020, ông Dũng đã kê khai tài sản, giải trình biến động, nguồn gốc tài sản, thu nhập không trung thực, không đầy đủ, không kịp thời là thiếu gương mẫu, chấp hành không nghiêm các quy định của Đảng, Nhà nước về kê khai, minh bạch tài sản, thu nhập.