Theo đó, ngày 13.5, tàu SE8 xuất phát từ ga Sài Gòn chạy qua khu gian Long Khánh – Bảo Chánh lúc 7h50 đã xảy ra hiện tượng xóc lắc rất mạnh toa xe (trong khoảng từ km 1643+600 – 1641+00) làm một số hành khách trên tàu hoảng loạn. Trưởng tàu đã trấn an hành khách, lập biên bản ghi nhận lại sự việc.

Cũng trong ngày 13.5, đoàn tàu SPT1 chạy đến km 1642+600 thuộc khu gian Bảo Chánh-Long Khánh đã xảy ra hiện tượng xóc lắc mạnh toa xe.

Trước đó, ngày 12.5, tàu SE3 chạy tới đoạn đường trên, trưởng tàu phát hiện tiếng động lạ nghi tàu trật bánh nên đã giật van hãm dừng lại để kiểm tra. Sau khi kiểm tra, phát hiện có 2 tà vẹt bêtông bị mẻ cách đuôi tàu khoảng 100m, ngoài ra không phát hiện gì khác về đoàn tàu nên điều khiển tàu chạy tiếp.

Nguyên nhân ban đầu được xác định do chất lượng nền đường ở đoạn đường sắt này có vấn đề. Trước tình hình trên, Công ty cổ phần Vận tải đường sắt Sài Gòn đề nghị Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam chỉ đạo các đơn vị liên quan khắc phục kịp thời hiện tượng trên nhằm đảm bảo an toàn chạy tàu.