Bảo tàng này sẽ do UBND tỉnh Vĩnh Long làm cơ quan chủ quản, có nhiệm vụ nghiên cứu, thu thập, bảo tồn, trưng bày và tổ chức các hoạt động về quá trình hình thành và phát triển nông nghiệp gắn liền với đời sống tinh thần của người dân ở ĐBSCL qua các thời kỳ nhằm phục vụ cho du lịch, học tập, nghiên cứu khoa học, thụ hưởng văn hoá của công chúng và quảng bá các sản phẩm nông nghiệp hiện nay ở ĐBSCL.

Nhiệm vụ trọng tâm của bảo tàng là sưu tầm, trưng bày, tổ chức các sự kiện liên quan đến nông nghiệp ở ĐBSCL phục vụ cho công chúng; nghiên cứu khoa học phục vụ cho việc bảo vệ và phát huy giá trị di sản văn hoá nông nghiệp ở vùng… Đối tượng phục vụ thuộc mọi thành phần trong xã hội, khách du lịch trong và ngoài nước;…

Địa điểm xây dựng bảo tàng dự kiến tại ấp Rạch Trúc, thị trấn Vũng Liêm, huyện Vũng Liêm, với tổng diện tích 11,4ha, được chia thành 4 khu chính: Khu 1 phục vụ trưng bày và hành chính gồm các khối sảnh, khối trưng bày chính, khối hội trường, khối thư viện, khối hành chính, khối kỹ thuật…;  Khu 2 tái hiện làng quê Nam bộ xưa; Khu 3 tổ chức sự kiện; và Khu 4 là các công trình phụ trợ…

Hiện vật và tư liệu của từng chuyên đề được sắp xếp theo tiến trình lịch sử vùng ĐBSCL qua 4 thời kỳ. Thời kỳ đầu (trước năm 1698): Nền nông nghiệp vương quốc Phù Nam và Chân Lạp. Thời kỳ thứ hai (từ năm 1698 – 1858): Quá trình Nam tiến và khẩn hoang của các chúa Nguyễn và Vương triều Nguyễn. Thời kỳ thứ ba (từ năm 1858 đến năm 1975): Tổ chức sản xuất nông nghiệp thời Pháp thuộc và Việt Nam Cộng hoà. Thời kỳ thứ tư (từ năm 1975 đến nay): Nền nông nghiệp thâm canh ở ĐBSCL thời kỳ đổi mới và hội nhập.

Dự kiến số lượng nhân sự ban đầu khoảng 30 người, và có thể tăng theo sự phát triển của bảo tàng.

Tổng kinh phí thực hiện đề án là 400 tỉ đồng, bao gồm ngân sách và xã hội hóa. Tiến độ thực hiện đề án được chia thành 3 giai đoạn. Trong đó, giai đoạn 1 sẽ hoàn chỉnh các thủ tục pháp lý (đến năm 2021);  Giai đoạn 2 là sưu tầm, thiết kế và thi công cơ sở hạ tầng (2022-2026); và giai đoạn 3 sẽ hoàn thiện đề án, khai thác và sử dụng (năm 2027)…

Theo UBND tỉnh Vĩnh Long, Việt Nam hiện có rất nhiều bảo tàng, nhưng chưa có nơi nào xây dựng bảo tàng nông nghiệp, một kho tàng văn hóa của nền văn minh lúa nước gắn chặt với đời sống của người dân Việt Nam, nhất là vùng đất nông nghiệp ĐBSCL...